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小桐子ACO1基因的克隆與表達(dá)分析

作者:辛胡; 唐利洲; 付義; 蔣凱文; 楊蕾; 劉家奇; 馬楠; 田斌; 王海波 西南林業(yè)大學(xué)國(guó)家林業(yè)局西南地區(qū)生物多樣性保育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 云南昆明650224; 曲靖師范學(xué)院/云南高原生物資源保護(hù)與利用研究中心; 云南曲靖655011; 曲靖師范學(xué)院/云南省高校云貴高原動(dòng)植物遺傳多樣性及生態(tài)適應(yīng)性重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 云南曲靖655011

摘要:為探討ACO1基因在小桐子抗逆中的作用,本研究基于小桐子最新注釋的基因組數(shù)據(jù)庫(kù),首次克隆了小桐子ACO1基因的全長(zhǎng)編碼框序列,命名為JcACO1,并對(duì)其功能結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進(jìn)化、基因結(jié)構(gòu)及器官和低溫表達(dá)特性進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,克隆的JcACO1基因全長(zhǎng)為1022bp,編碼319個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量為36.0kDa,等電點(diǎn)5.5。序列比對(duì)表明,小桐子JcACO1在序列中部保守性較高,具有1個(gè)Pcbc superfamily保守結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化樹分析顯示,小桐子JcACO1基因與毛果楊、橡膠樹、木薯的同源性較高。qRT-PCR表達(dá)分析表明,小桐子幼苗JcACO1基因存在器官表達(dá)特異性,在葉與莖中表達(dá)量較高,而在根中表達(dá)量較低。另外,JcACO1基因在三種器官中都受低溫誘導(dǎo),低溫脅迫24h時(shí),基因在根與莖中表達(dá)量最大。說(shuō)明JcACO1基因表達(dá)量升高,以響應(yīng)小桐子的抗冷脅迫。

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