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基于測序技術(shù)的海南地方豬TLR2基因多態(tài)性分析

作者:張艷; 劉海隆; 王文秀; 黃麗麗 海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所; 海南???71100; 海南省熱帶動物繁育與疫病研究重點實驗室; 海南???71100; 山東省濱州畜牧獸醫(yī)研究院; 山東濱州256600

摘要:為了解海南地方豬TLR2基因的多態(tài)性,本研究采用PCR法從五指山豬、臨高豬和屯昌豬3種海南地方豬的血液中克隆Toll樣受體2(TLR2)基因,并進行測序及序列分析。結(jié)果顯示,3種海南地方豬TLR2基因的擴增長度均為2649bp,編碼區(qū)長2358bp。3種豬TLR2基因序列的種內(nèi)比對結(jié)果顯示,五指山豬種內(nèi)有7個核苷酸位點存在多態(tài)性,2處位于編碼區(qū);屯昌豬種內(nèi)有5個核苷酸位點存在多態(tài)性,均在編碼區(qū)外;臨高豬種內(nèi)有4個核苷酸位點存在多態(tài)性,1處位于編碼區(qū)。種間比對結(jié)果顯示3種豬有12個核苷酸位點存在多態(tài)性,其中3處為錯義突變,導(dǎo)致氨基酸改變。同源性分析結(jié)果顯示,3種豬的TLR2基因序列高度保守,同源性在99.6%~99.9%之間。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測分析顯示,海南豬TLR2基因在876、1454位點呈現(xiàn)的AG突變均引起了其蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的改變,提示可能存在TLR2功能的變化。本研究填補了海南地方豬TLR2基因多態(tài)性空白,為深入研究TLR2基因多態(tài)性與豬疫病易感性的關(guān)系提供基礎(chǔ)研究資料。

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畜牧與獸醫(yī)

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