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琥珀酸對酵母細胞轉(zhuǎn)錄組的影響

作者:THEKRA; Khushafa; 童僑; 范磊; 劉雪飛; 黃新河 西南交通大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院; 成都610031

摘要:尋找抗衰老活性小分子并研究其作用機制是衰老藥物學(xué)研究的重點和熱點。本文報道了一種新的抗衰老活性小分子琥珀酸,發(fā)現(xiàn)琥珀酸可以顯著延緩芽殖酵母細胞的衰老并增強細胞的壓力抗性。隨后,利用DNA Microarray技術(shù)及生物信息學(xué)手段較系統(tǒng)分析了琥珀酸處理對基因表達譜、基因本體聚類及相關(guān)信號通路的影響。結(jié)果顯示,琥珀酸處理對細胞轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)生了顯著影響,共導(dǎo)致3 485個基因的差異表達(P〈0.05),其中1 335個基因顯著上調(diào),2 150個基因顯著下調(diào)。進一步對基因本體聚類及信號通路分析顯示,線粒體及核糖體生物合成相關(guān)的分子功能、細胞組分、生物學(xué)過程和信號通路可能是琥珀酸作用的主要靶點,其他可能的作用靶點還包括蛋白酶體、細胞內(nèi)吞、過氧化物酶體代謝及細胞自噬等。本研究為進一步闡明琥珀酸介導(dǎo)的壽命及壓力調(diào)控機制提供了理論參考和研究線索。

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生物信息學(xué)

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