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FOXD3的空間結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析

作者:劉暢; 劉安 長治醫(yī)學院中心實驗室; 山西長治046000; 山西醫(yī)科大學基礎(chǔ)醫(yī)學院生物化學與分子生物學教研室; 太原030001; 長治醫(yī)學院附屬和濟醫(yī)院骨科; 山西長治046000

摘要:FOXD3(Forkhead box D3)作為一個有價值的腫瘤預后標志物,其抑癌機制和預后價值仍未被完全闡明。為了全面認識FOXD3,本研究利用生物信息學手段,對FOXD3蛋白的氨基酸序列同源性、理化性質(zhì)、組織表達、亞細胞定位、空間結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡進行了預測和分析。結(jié)果表明:人FOXD3蛋白是酸性不穩(wěn)定的親水蛋白,在進化過程中高度保守,無信號肽和跨膜區(qū)域,屬于FH超家族。該蛋白定位于細胞核的可能性最大,主要二級結(jié)構(gòu)為無規(guī)卷曲。經(jīng)GO分析和KEGG通路分析可知,與FOXD3相互作用的蛋白主要是轉(zhuǎn)錄因子,參與調(diào)控細胞干性的蛋白質(zhì)和調(diào)控腫瘤細胞特性的蛋白質(zhì)。本文結(jié)果為進一步研究FOXD3的功能及抑癌機制提供一定的參考。

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生物信息學

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