摘要：基于宏條形碼技術(shù)的物種快速檢測(cè)有助于生物多樣性的評(píng)估、預(yù)測(cè)和保護(hù)。本文介紹了常用宏條形碼分析的步驟和參數(shù)設(shè)定方法。我們利用Nextflow搭建了一款宏條形碼分析流程EPPS,可以自動(dòng)化地運(yùn)行從原始數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制到環(huán)境多樣性的比較。Nextflow軟件還擁有流程監(jiān)控的功能,可視化輸出每個(gè)進(jìn)程所消耗的時(shí)間與內(nèi)存。本文還使用測(cè)試數(shù)據(jù)和已發(fā)表數(shù)據(jù)證明該平臺(tái)能夠有效地分析宏條形碼數(shù)據(jù)并可靠地分析環(huán)境生物多樣性的相似性。