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DNA條形碼參考數(shù)據(jù)集構(gòu)建和序列分析相關(guān)的新興技術(shù)

作者:劉山林 中國農(nóng)業(yè)大學植物保護學院; 食品營養(yǎng)與人類健康高精尖創(chuàng)新中心; 北京100193

摘要:近年來DNA條形碼技術(shù)迅速發(fā)展,產(chǎn)生的條形碼的數(shù)量及其應(yīng)用范圍都呈指數(shù)性增長,現(xiàn)已廣泛用于物種鑒定、食性分析、生物多樣性評估等方面。本文重點總結(jié)并討論了構(gòu)建條形碼參考數(shù)據(jù)庫和序列聚類相關(guān)的信息分析的技術(shù)和方法,包括:基于高通量測序(high throughput sequencing, HTS)平臺以高效并較低的成本獲取條形碼序列的方法;同時還介紹了從原始測序序列到分類操作單元(operational taxonomic units, OTUs)過程中的一些計算邏輯以及被廣泛采用的軟件和技術(shù)。這是一個較新并快速發(fā)展的領(lǐng)域,我們希望本文能為讀者提供一個梗概,了解DNA條形碼技術(shù)在生物多樣性研究應(yīng)用中的方法和手段。

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生物多樣性

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