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細胞分裂周期蛋白6拷貝數(shù)變異與肺腺癌患者預后關系的研究

作者:寇瑞環(huán); 謝俞寧; 李佳瑩; 金葉; 張志; 張雪梅 華北理工大學附屬唐山市工人醫(yī)院腫瘤科; 河北唐山063210; 華北理工大學生命科學學院; 河北唐山063210

摘要:目的探討細胞分裂周期蛋白6(CDC6)基因在肺腺癌組織中的拷貝數(shù)變異(CNV)對肺腺癌預后的影響。方法從癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中獲取肺腺癌患者的轉(zhuǎn)錄譜(mRNA)數(shù)據(jù)、CNV數(shù)據(jù)及臨床資料,使用基因表達譜動態(tài)分析(GEPIA)數(shù)據(jù)庫對CDC6基因在肺腺癌組織中的表達情況,及其與CDC6基因CNV和肺腺癌患者預后的關系進行分析。篩選CDC6基因的共表達基因,并進行基因組百科全書(KEGG)通路分析及基因本體(GO)功能富集分析。結(jié)果肺腺癌患者腫瘤組織中CDC6基因CNV與CDC6mRNA的表達量呈正相關(P﹤0.01)。CDC6低表達組肺腺癌患者的生存結(jié)局明顯優(yōu)于CDC6高表達組患者(P﹤0.01)。KEGG通路分析結(jié)果顯示:CDC6基因的共表達基因富集在DNA復制、錯配修復、核苷酸切除修復等修復相關通路。GO功能富集分析結(jié)果顯示:在生物學過程層面,CDC6基因的共表達基因主要參與了DNA鏈的延伸、核酸切除修復、蛋白質(zhì)去甲酰化、轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)切除修復、WNT信號通路、平面細胞極性通路、核因子-κB誘導激酶(NIK)/核因子-κB(NF-κB)信號通路;在細胞構(gòu)成層面,CDC6基因的共表達基因參與了T復合物、透明帶受體復合物、驅(qū)動蛋白復合體、DNA復制因子C復合物的形成;在分子功能層面,CDC6基因的共表達基因參與四鏈體DNA結(jié)合。結(jié)論CDC6基因CNV可以對肺腺癌組織中CDC6基因的表達進行調(diào)控,CDC6基因及其共表達基因可對肺腺癌的DNA復制、修復過程和腫瘤相關信號通路進行調(diào)控并可能以此為基礎影響肺腺癌的發(fā)展進程。CDC6基因高表達肺腺癌患者的預后不良,其可能成為預測肺腺癌臨床預后的有效生物標志物。

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